中科院生物化學(xué)與細(xì)胞生物學(xué)研究所景乃禾課題組新近創(chuàng)立了一種技術(shù)方法，可以獲得具有空間位置信息的少量細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組圖譜。相關(guān)研究成果日前在線發(fā)表于《自然—實驗室指南》。
　　無論是體內(nèi)組織還是體外細(xì)胞系，不同細(xì)胞之間都存在著差異性，即細(xì)胞的異質(zhì)性。細(xì)胞的異質(zhì)性對解釋腫瘤的發(fā)生、干細(xì)胞或前體細(xì)胞的多能性與譜系分化、干細(xì)胞與微環(huán)境的相互作用等具有重要意義。近些年，單細(xì)胞測序技術(shù)迅速發(fā)展，使得研究細(xì)胞之間的異質(zhì)性成為可能。然而，目前單細(xì)胞測序的方法均會丟失細(xì)胞在體內(nèi)原有的位置信息，而對某些研究領(lǐng)域如發(fā)育生物學(xué)、腫瘤生物學(xué)而言，細(xì)胞來源的位置信息是十分關(guān)鍵的。
　　在景乃禾和彭廣敦的指導(dǎo)下，陳軍通過整合與優(yōu)化單細(xì)胞測序和激光顯微切割技術(shù)，構(gòu)建了一種能夠獲得少量細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組信息，同時保留細(xì)胞原有位置信息的測序方法：Geo-seq。
　　Geo-seq是一種高效、高分辨率的空間轉(zhuǎn)錄組分析方案，既可用于轉(zhuǎn)錄圖譜的三維重建，也可用于研究具有特殊結(jié)構(gòu)的少量組織或細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄組信息。利用Geo-seq技術(shù)，該課題組繪制了小鼠早期胚胎原腸運動中期精細(xì)的三維分子圖譜，并揭示了小鼠細(xì)胞譜系藍(lán)圖建立過程中的空間轉(zhuǎn)錄組特征、轉(zhuǎn)錄因子和信號通路調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。
　　據(jù)悉，Geo-seq技術(shù)已成功應(yīng)用于小鼠大腦發(fā)育、肝臟腫瘤學(xué)以及人的精子發(fā)育等研究中。
　?。ㄔd于《中國科學(xué)報》 2017-02-23 第1版 要聞)