異子蓬（Suaeda aralocaspica）是一年生真鹽生植物，主要分布于中亞，在中國僅產(chǎn)于新疆。異子蓬在耐鹽特性、光合作用和種子性狀等方面具有重要的研究價(jià)值。異子蓬能夠在表層土壤含鹽量超過10%的環(huán)境中正常生長，種子萌發(fā)耐鹽性超過1000mmol/L NaCl。異子蓬的葉片、花被片和果實(shí)都能在單個(gè)細(xì)胞內(nèi)完成C₄光合作用，這與典型的具有花環(huán)結(jié)構(gòu)(Kranz)的C₄植物不同。另外，異子蓬能在同一果序的不同位置產(chǎn)生棕色和黑色兩種類型的種子。

　　2019年9月，中國科學(xué)院新疆生態(tài)與地理研究所研究員田長彥團(tuán)隊(duì)完成了異子蓬全基因組的測序、組裝，成功繪制了異子蓬的全基因組草圖。這是目前世界上首個(gè)測序的真鹽生植物和單細(xì)胞C₄植物。組裝完成的異子蓬基因組大小約452Mb，占預(yù)估異子蓬基因組大小的96.8%。共組裝得到4033個(gè)scaffolds，scaffold N50為1.83Mb。結(jié)合MAKER注釋、同源蛋白序列注釋以及來自不同組織的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)，該研究共注釋得到29604個(gè)蛋白編碼基因，1651個(gè)長非編碼RNA，21個(gè) microRNA?；蚪M重復(fù)序列比例為38.41%，其中48.5%為LTR逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子。根據(jù)BUSCO分析，基因組完整性為89.5%。此外，該研究還構(gòu)建了全長146654 bp的完整葉綠體基因組。

　　該研究獲得新疆維吾爾自治區(qū)重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃項(xiàng)目、國家自然科學(xué)基金和國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃的資助。以上研究成果以A draft genome assembly of halophyte Suaeda aralocaspica, a plant that performs C₄ photosynthesis within individual cells 為題發(fā)表于GigaScience。

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